医药物流仓储规划和布局，对于医药仓储的管理和运作最基本的要点，也是难点。现在仓库在整体的供应链链路中承担了越来越多的责任，也拥有了越来越多的功能，因此打造一个功能齐全、设施完善、效率高人力投入少的仓库是医药物流仓储运作的基础。
仓库布局原则
1.作业优化
通过一次性作业，减少装卸的次数，缩短从装卸至库位的搬运距离。用最短的搬运距离，最少的搬运环节，从而提升仓库作业的效率。
2.单一的流通走向
尽量保持直线作业，避免迂回逆向作业；仓库则只固定唯一的物流出口和入口，同时方便对库内环节运作的管理和监控。
3.存储性质一致
在同一区域保管的货物必须相互可以兼容，当货物的性质互相有影响或相互有抵触时，不能在相同的库房内保存。
4.避免混存发生
保管条件不同的货物不可以混合存放。作业手段不同的货物不能混存。灭火措施不同的货物不能混存。
5.节省建设投资
医药物流仓储中的延伸型设施——供电、供水、供暖、通讯等设施对基建投资和运行费用的影响都很大，应该尽可能的集中布置。
规划区域原则
1.按照功能分区
合理规划分布设计的区域，能帮助医药物流仓储作业的效率、质量、成本和赢利目标的实现很大的提升。一般使用面积的1/3被用作非仓储功能。除非受条件所限将物流出入口规划在一个区域。
2.标注通道
通道畅通；物流的入口和出口要挂牌；将通道和功能区域在地面做出标记规划出来。分为主通道、副通道、检查通道。需要路面平整和平直，减少转弯和较差。
3.商品性质
按照库存商品理化性质不同进行分区，确定存入同一库房的物资品种理化性质相同，便于采取养护措施；如：金属区、塑料区、纺织区、冷藏区、危险品区等。
按照库存商品使用方向不同进行分区，如专用品：中药、西药、保健品；
货位摆放原则
1.排序原则
出入库频次高且出入量比较大的品种可以放在离物流出口最近的库位货架上，这样可以提高快进快出的一个效率；随着产品的生命周期、季节等因素的变化，库存周转率也会变化，这时候就需要对库位的摆放进行重新的规划。
2.统一原则
如果是普通地堆货架仓库，那同一类的物料需要集中保管在统一的货位区域内，便于统一管理，避免多货位提货；如果是自动化立体仓库则不用遵守这个原则。
3.系列原则
对同一系列的物料的属性来进行设置区域，如油品区、半轴区、轴承区、标准件区、橡胶件区、易损件区等。
4.批号管理原则
针对于食品、药品、化妆品等着一些对产品有效期比较敏感的商品，要根据一个批号单独放在一个货位上；做到通过先进先出，严格管理。如果同一批号的商品检验不合格或者早产不允许放行，要设立红牌警示，避免混出工厂，产生质量事故；
5.面对通道原则
围绕着各个区域和商品规划一个合理的进出路线通道，这样可以使分拣人员能够始终流畅地进行工作，不围不堵。
6.合理搭配原则
要考虑物料的形状大小，根据实际仓库的条件，合理搭配空间；避免空间不足多货位放货，避免空间太大使用不充分。
7.上轻下重原则
楼上或上层货位摆放重量轻的物料，楼下或者下层货位摆放重量大的物料，这样可以减轻搬运强度，保证货架、建筑与人员的安全。